Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187BQ17R55 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FAM187BQ17R55 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FAM187BQ17R55 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FAM187BQ17R55 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FAM187BQ17R55 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FAM187BQ17R55 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FAM187BQ17R55 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FAM187BQ17R55 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FAM187BQ17R55 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FAM187BQ17R55 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FAM187BQ17R55 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FAM187BQ17R55 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FAM187BQ17R55 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
FAM187BQ17R55 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
FAM187BQ17R55 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FAM187BQ17R55 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FAM187BQ17R55 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FAM187BQ17R55 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FAM187BQ17R55 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FAM187BQ17R55 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FAM187BQ17R55 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FAM187BQ17R55 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FAM187BQ17R55 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FAM187BQ17R55 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FAM187BQ17R55 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FAM187BQ17R55 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FAM187BQ17R55 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FAM187BQ17R55 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FAM187BQ17R55 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FAM187BQ17R55 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FAM187BQ17R55 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FAM187BQ17R55 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FAM187BQ17R55 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FAM187BQ17R55 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FAM187BQ17R55 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FAM187BQ17R55 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
FAM187BQ17R55 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FAM187BQ17R55 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FAM187BQ17R55 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FAM187BQ17R55 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FAM187BQ17R55 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FAM187BQ17R55 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FAM187BQ17R55 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
FAM187BQ17R55 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FAM187BQ17R55 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
FAM187BQ17R55 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
FAM187BQ17R55 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
FAM187BQ17R55 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FAM187BQ17R55 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FAM187BQ17R55 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FAM187BQ17R55 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
FAM187BQ17R55 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FAM187BQ17R55 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FAM187BQ17R55 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FAM187BQ17R55 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FAM187BQ17R55 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FAM187BQ17R55 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FAM187BQ17R55 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FAM187BQ17R55 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FAM187BQ17R55 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FAM187BQ17R55 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FAM187BQ17R55 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FAM187BQ17R55 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FAM187BQ17R55 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FAM187BQ17R55 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FAM187BQ17R55 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FAM187BQ17R55 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FAM187BQ17R55 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FAM187BQ17R55 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FAM187BQ17R55 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FAM187BQ17R55 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FAM187BQ17R55 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FAM187BQ17R55 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FAM187BQ17R55 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FAM187BQ17R55 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FAM187BQ17R55 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FAM187BQ17R55 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FAM187BQ17R55 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FAM187BQ17R55 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FAM187BQ17R55 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FAM187BQ17R55 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FAM187BQ17R55 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FAM187BQ17R55 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FAM187BQ17R55 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FAM187BQ17R55 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FAM187BQ17R55 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FAM187BQ17R55 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FAM187BQ17R55 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FAM187BQ17R55 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FAM187BQ17R55 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FAM187BQ17R55 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FAM187BQ17R55 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FAM187BQ17R55 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FAM187BQ17R55 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FAM187BQ17R55 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FAM187BQ17R55 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FAM187BQ17R55 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FAM187BQ17R55 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FAM187BQ17R55 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FAM187BQ17R55 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms