Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPROQ16827 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPROQ16827 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PTPROQ16827 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPROQ16827 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPROQ16827 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPROQ16827 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPROQ16827 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPROQ16827 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPROQ16827 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPROQ16827 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPROQ16827 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPROQ16827 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPROQ16827 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPROQ16827 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPROQ16827 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPROQ16827 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPROQ16827 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPROQ16827 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPROQ16827 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPROQ16827 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPROQ16827 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPROQ16827 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPROQ16827 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPROQ16827 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPROQ16827 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPROQ16827 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPROQ16827 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPROQ16827 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPROQ16827 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPROQ16827 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPROQ16827 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPROQ16827 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PTPROQ16827 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPROQ16827 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPROQ16827 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPROQ16827 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPROQ16827 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPROQ16827 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPROQ16827 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPROQ16827 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPROQ16827 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPROQ16827 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPROQ16827 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPROQ16827 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPROQ16827 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPROQ16827 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPROQ16827 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPROQ16827 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPROQ16827 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPROQ16827 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPROQ16827 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPROQ16827 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPROQ16827 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPROQ16827 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPROQ16827 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPROQ16827 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPROQ16827 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPROQ16827 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPROQ16827 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPROQ16827 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPROQ16827 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPROQ16827 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPROQ16827 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPROQ16827 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPROQ16827 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPROQ16827 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PTPROQ16827 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPROQ16827 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPROQ16827 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPROQ16827 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPROQ16827 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPROQ16827 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPROQ16827 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPROQ16827 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPROQ16827 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPROQ16827 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPROQ16827 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPROQ16827 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPROQ16827 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPROQ16827 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPROQ16827 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPROQ16827 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPROQ16827 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPROQ16827 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPROQ16827 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPROQ16827 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPROQ16827 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPROQ16827 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPROQ16827 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPROQ16827 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPROQ16827 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPROQ16827 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPROQ16827 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPROQ16827 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPROQ16827 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPROQ16827 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPROQ16827 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPROQ16827 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPROQ16827 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
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