Protein–RNA interactions for Protein: Q16821

PPP1R3A, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 3A, humanhuman

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R3AQ16821 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PPP1R3AQ16821 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PPP1R3AQ16821 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PPP1R3AQ16821 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PPP1R3AQ16821 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PPP1R3AQ16821 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PPP1R3AQ16821 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PPP1R3AQ16821 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PPP1R3AQ16821 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PPP1R3AQ16821 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PPP1R3AQ16821 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PPP1R3AQ16821 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PPP1R3AQ16821 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PPP1R3AQ16821 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PPP1R3AQ16821 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PPP1R3AQ16821 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PPP1R3AQ16821 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PPP1R3AQ16821 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PPP1R3AQ16821 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PPP1R3AQ16821 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PPP1R3AQ16821 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PPP1R3AQ16821 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PPP1R3AQ16821 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PPP1R3AQ16821 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PPP1R3AQ16821 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PPP1R3AQ16821 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PPP1R3AQ16821 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PPP1R3AQ16821 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PPP1R3AQ16821 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PPP1R3AQ16821 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PPP1R3AQ16821 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PPP1R3AQ16821 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PPP1R3AQ16821 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PPP1R3AQ16821 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PPP1R3AQ16821 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PPP1R3AQ16821 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PPP1R3AQ16821 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PPP1R3AQ16821 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PPP1R3AQ16821 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PPP1R3AQ16821 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PPP1R3AQ16821 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PPP1R3AQ16821 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PPP1R3AQ16821 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PPP1R3AQ16821 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PPP1R3AQ16821 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PPP1R3AQ16821 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PPP1R3AQ16821 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PPP1R3AQ16821 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PPP1R3AQ16821 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PPP1R3AQ16821 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PPP1R3AQ16821 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PPP1R3AQ16821 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PPP1R3AQ16821 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PPP1R3AQ16821 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PPP1R3AQ16821 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PPP1R3AQ16821 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PPP1R3AQ16821 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PPP1R3AQ16821 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PPP1R3AQ16821 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PPP1R3AQ16821 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PPP1R3AQ16821 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PPP1R3AQ16821 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PPP1R3AQ16821 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PPP1R3AQ16821 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PPP1R3AQ16821 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PPP1R3AQ16821 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PPP1R3AQ16821 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PPP1R3AQ16821 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PPP1R3AQ16821 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PPP1R3AQ16821 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PPP1R3AQ16821 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PPP1R3AQ16821 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PPP1R3AQ16821 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PPP1R3AQ16821 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PPP1R3AQ16821 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PPP1R3AQ16821 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PPP1R3AQ16821 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PPP1R3AQ16821 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PPP1R3AQ16821 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PPP1R3AQ16821 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PPP1R3AQ16821 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PPP1R3AQ16821 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PPP1R3AQ16821 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PPP1R3AQ16821 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PPP1R3AQ16821 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PPP1R3AQ16821 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PPP1R3AQ16821 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PPP1R3AQ16821 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PPP1R3AQ16821 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PPP1R3AQ16821 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PPP1R3AQ16821 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PPP1R3AQ16821 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PPP1R3AQ16821 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PPP1R3AQ16821 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PPP1R3AQ16821 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PPP1R3AQ16821 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PPP1R3AQ16821 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PPP1R3AQ16821 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PPP1R3AQ16821 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PPP1R3AQ16821 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms