Protein–RNA interactions for Protein: Q16790

CA9, Carbonic anhydrase 9, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA9Q16790 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CA9Q16790 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CA9Q16790 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CA9Q16790 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CA9Q16790 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CA9Q16790 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CA9Q16790 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CA9Q16790 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CA9Q16790 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CA9Q16790 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CA9Q16790 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CA9Q16790 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CA9Q16790 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CA9Q16790 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CA9Q16790 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CA9Q16790 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CA9Q16790 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CA9Q16790 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CA9Q16790 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CA9Q16790 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CA9Q16790 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CA9Q16790 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CA9Q16790 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CA9Q16790 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CA9Q16790 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CA9Q16790 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CA9Q16790 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CA9Q16790 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CA9Q16790 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CA9Q16790 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CA9Q16790 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CA9Q16790 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CA9Q16790 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CA9Q16790 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CA9Q16790 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CA9Q16790 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CA9Q16790 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CA9Q16790 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CA9Q16790 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CA9Q16790 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CA9Q16790 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CA9Q16790 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CA9Q16790 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CA9Q16790 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CA9Q16790 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CA9Q16790 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CA9Q16790 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CA9Q16790 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CA9Q16790 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CA9Q16790 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CA9Q16790 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CA9Q16790 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CA9Q16790 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CA9Q16790 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CA9Q16790 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CA9Q16790 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CA9Q16790 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CA9Q16790 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CA9Q16790 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CA9Q16790 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CA9Q16790 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CA9Q16790 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CA9Q16790 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CA9Q16790 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CA9Q16790 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CA9Q16790 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CA9Q16790 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CA9Q16790 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CA9Q16790 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CA9Q16790 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CA9Q16790 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CA9Q16790 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CA9Q16790 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CA9Q16790 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CA9Q16790 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CA9Q16790 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CA9Q16790 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CA9Q16790 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CA9Q16790 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CA9Q16790 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CA9Q16790 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CA9Q16790 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CA9Q16790 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CA9Q16790 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CA9Q16790 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CA9Q16790 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CA9Q16790 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CA9Q16790 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CA9Q16790 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CA9Q16790 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CA9Q16790 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CA9Q16790 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CA9Q16790 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CA9Q16790 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CA9Q16790 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CA9Q16790 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CA9Q16790 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CA9Q16790 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CA9Q16790 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CA9Q16790 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms