Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms