Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
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ZNF239Q16600 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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ZNF239Q16600 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZNF239Q16600 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.1 ms