Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SGCBQ16585 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SGCBQ16585 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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