Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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SSX1Q16384 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
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SSX1Q16384 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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SSX1Q16384 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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SSX1Q16384 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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SSX1Q16384 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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SSX1Q16384 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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SSX1Q16384 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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SSX1Q16384 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSX1Q16384 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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