Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

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Length 413 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 BX547991.1-201ENST00000582543 1206 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC19.62■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 RN7SL371P-201ENST00000578099 267 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
E2F4Q16254 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
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