Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GRIK4Q16099 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
GRIK4Q16099 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GRIK4Q16099 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GRIK4Q16099 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GRIK4Q16099 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GRIK4Q16099 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GRIK4Q16099 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GRIK4Q16099 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GRIK4Q16099 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
GRIK4Q16099 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GRIK4Q16099 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GRIK4Q16099 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GRIK4Q16099 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GRIK4Q16099 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GRIK4Q16099 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GRIK4Q16099 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GRIK4Q16099 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GRIK4Q16099 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GRIK4Q16099 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GRIK4Q16099 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GRIK4Q16099 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GRIK4Q16099 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GRIK4Q16099 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GRIK4Q16099 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
GRIK4Q16099 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GRIK4Q16099 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GRIK4Q16099 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GRIK4Q16099 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GRIK4Q16099 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GRIK4Q16099 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GRIK4Q16099 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GRIK4Q16099 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GRIK4Q16099 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GRIK4Q16099 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GRIK4Q16099 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GRIK4Q16099 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GRIK4Q16099 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GRIK4Q16099 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GRIK4Q16099 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GRIK4Q16099 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GRIK4Q16099 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GRIK4Q16099 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GRIK4Q16099 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GRIK4Q16099 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
GRIK4Q16099 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GRIK4Q16099 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GRIK4Q16099 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GRIK4Q16099 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GRIK4Q16099 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GRIK4Q16099 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
GRIK4Q16099 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GRIK4Q16099 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GRIK4Q16099 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GRIK4Q16099 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GRIK4Q16099 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GRIK4Q16099 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GRIK4Q16099 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GRIK4Q16099 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GRIK4Q16099 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GRIK4Q16099 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GRIK4Q16099 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GRIK4Q16099 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GRIK4Q16099 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GRIK4Q16099 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GRIK4Q16099 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GRIK4Q16099 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GRIK4Q16099 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GRIK4Q16099 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GRIK4Q16099 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GRIK4Q16099 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GRIK4Q16099 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GRIK4Q16099 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GRIK4Q16099 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
GRIK4Q16099 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GRIK4Q16099 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
GRIK4Q16099 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GRIK4Q16099 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
GRIK4Q16099 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
GRIK4Q16099 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GRIK4Q16099 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
GRIK4Q16099 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GRIK4Q16099 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GRIK4Q16099 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GRIK4Q16099 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GRIK4Q16099 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GRIK4Q16099 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GRIK4Q16099 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GRIK4Q16099 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GRIK4Q16099 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GRIK4Q16099 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GRIK4Q16099 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GRIK4Q16099 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GRIK4Q16099 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GRIK4Q16099 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GRIK4Q16099 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GRIK4Q16099 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GRIK4Q16099 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GRIK4Q16099 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GRIK4Q16099 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
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