Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC12.5□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 INTS1-201ENST00000404767 6959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
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VAMP3Q15836 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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VAMP3Q15836 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
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VAMP3Q15836 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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VAMP3Q15836 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 FAM120C-202ENST00000375180 8057 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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VAMP3Q15836 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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VAMP3Q15836 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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VAMP3Q15836 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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VAMP3Q15836 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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VAMP3Q15836 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC12.48□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC12.48□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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