Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ALX1Q15699 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ALX1Q15699 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ALX1Q15699 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ALX1Q15699 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ALX1Q15699 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ALX1Q15699 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ALX1Q15699 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ALX1Q15699 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ALX1Q15699 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ALX1Q15699 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ALX1Q15699 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ALX1Q15699 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ALX1Q15699 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ALX1Q15699 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ALX1Q15699 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ALX1Q15699 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ALX1Q15699 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ALX1Q15699 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ALX1Q15699 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ALX1Q15699 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ALX1Q15699 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ALX1Q15699 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ALX1Q15699 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ALX1Q15699 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ALX1Q15699 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ALX1Q15699 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ALX1Q15699 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ALX1Q15699 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ALX1Q15699 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ALX1Q15699 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ALX1Q15699 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ALX1Q15699 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ALX1Q15699 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ALX1Q15699 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ALX1Q15699 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ALX1Q15699 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ALX1Q15699 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ALX1Q15699 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ALX1Q15699 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ALX1Q15699 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ALX1Q15699 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ALX1Q15699 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ALX1Q15699 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ALX1Q15699 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ALX1Q15699 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ALX1Q15699 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ALX1Q15699 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ALX1Q15699 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ALX1Q15699 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ALX1Q15699 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ALX1Q15699 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ALX1Q15699 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ALX1Q15699 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ALX1Q15699 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ALX1Q15699 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ALX1Q15699 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ALX1Q15699 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ALX1Q15699 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ALX1Q15699 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ALX1Q15699 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ALX1Q15699 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ALX1Q15699 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ALX1Q15699 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ALX1Q15699 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ALX1Q15699 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ALX1Q15699 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ALX1Q15699 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
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ALX1Q15699 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ALX1Q15699 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ALX1Q15699 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ALX1Q15699 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ALX1Q15699 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ALX1Q15699 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ALX1Q15699 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ALX1Q15699 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ALX1Q15699 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ALX1Q15699 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ALX1Q15699 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ALX1Q15699 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ALX1Q15699 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ALX1Q15699 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ALX1Q15699 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ALX1Q15699 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ALX1Q15699 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ALX1Q15699 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ALX1Q15699 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ALX1Q15699 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ALX1Q15699 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ALX1Q15699 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ALX1Q15699 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ALX1Q15699 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ALX1Q15699 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ALX1Q15699 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
ALX1Q15699 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ALX1Q15699 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ALX1Q15699 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ALX1Q15699 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ALX1Q15699 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
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