Protein–RNA interactions for Protein: Q15650

TRIP4, Activating signal cointegrator 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 581 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP4Q15650 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIP4Q15650 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIP4Q15650 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIP4Q15650 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIP4Q15650 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIP4Q15650 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIP4Q15650 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIP4Q15650 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIP4Q15650 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIP4Q15650 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIP4Q15650 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIP4Q15650 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIP4Q15650 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIP4Q15650 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIP4Q15650 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIP4Q15650 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIP4Q15650 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIP4Q15650 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIP4Q15650 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIP4Q15650 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIP4Q15650 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIP4Q15650 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIP4Q15650 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIP4Q15650 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIP4Q15650 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIP4Q15650 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIP4Q15650 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIP4Q15650 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIP4Q15650 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIP4Q15650 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIP4Q15650 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIP4Q15650 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIP4Q15650 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIP4Q15650 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIP4Q15650 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIP4Q15650 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIP4Q15650 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIP4Q15650 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIP4Q15650 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIP4Q15650 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIP4Q15650 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIP4Q15650 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIP4Q15650 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIP4Q15650 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIP4Q15650 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIP4Q15650 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIP4Q15650 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIP4Q15650 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIP4Q15650 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIP4Q15650 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIP4Q15650 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIP4Q15650 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIP4Q15650 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIP4Q15650 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIP4Q15650 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIP4Q15650 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIP4Q15650 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIP4Q15650 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIP4Q15650 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIP4Q15650 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIP4Q15650 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIP4Q15650 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIP4Q15650 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIP4Q15650 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIP4Q15650 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIP4Q15650 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIP4Q15650 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIP4Q15650 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIP4Q15650 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIP4Q15650 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIP4Q15650 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIP4Q15650 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIP4Q15650 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIP4Q15650 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIP4Q15650 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIP4Q15650 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIP4Q15650 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIP4Q15650 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIP4Q15650 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIP4Q15650 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIP4Q15650 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIP4Q15650 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIP4Q15650 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIP4Q15650 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIP4Q15650 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIP4Q15650 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIP4Q15650 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIP4Q15650 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIP4Q15650 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIP4Q15650 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIP4Q15650 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIP4Q15650 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIP4Q15650 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIP4Q15650 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIP4Q15650 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIP4Q15650 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIP4Q15650 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIP4Q15650 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIP4Q15650 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIP4Q15650 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
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