Protein–RNA interactions for Protein: Q15637

SF1, Splicing factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF1Q15637 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SF1Q15637 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SF1Q15637 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SF1Q15637 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SF1Q15637 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SF1Q15637 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SF1Q15637 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SF1Q15637 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SF1Q15637 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SF1Q15637 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SF1Q15637 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SF1Q15637 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SF1Q15637 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SF1Q15637 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SF1Q15637 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SF1Q15637 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SF1Q15637 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SF1Q15637 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SF1Q15637 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SF1Q15637 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SF1Q15637 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SF1Q15637 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SF1Q15637 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SF1Q15637 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SF1Q15637 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SF1Q15637 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SF1Q15637 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SF1Q15637 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SF1Q15637 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SF1Q15637 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SF1Q15637 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SF1Q15637 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SF1Q15637 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SF1Q15637 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SF1Q15637 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SF1Q15637 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SF1Q15637 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SF1Q15637 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SF1Q15637 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SF1Q15637 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SF1Q15637 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SF1Q15637 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SF1Q15637 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SF1Q15637 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SF1Q15637 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SF1Q15637 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SF1Q15637 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SF1Q15637 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SF1Q15637 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SF1Q15637 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SF1Q15637 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SF1Q15637 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SF1Q15637 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SF1Q15637 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SF1Q15637 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SF1Q15637 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SF1Q15637 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SF1Q15637 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SF1Q15637 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SF1Q15637 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SF1Q15637 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SF1Q15637 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SF1Q15637 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SF1Q15637 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SF1Q15637 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SF1Q15637 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SF1Q15637 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SF1Q15637 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SF1Q15637 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SF1Q15637 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SF1Q15637 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SF1Q15637 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SF1Q15637 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SF1Q15637 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SF1Q15637 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SF1Q15637 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SF1Q15637 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SF1Q15637 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SF1Q15637 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SF1Q15637 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SF1Q15637 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SF1Q15637 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SF1Q15637 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SF1Q15637 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SF1Q15637 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SF1Q15637 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SF1Q15637 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SF1Q15637 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SF1Q15637 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SF1Q15637 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SF1Q15637 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SF1Q15637 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SF1Q15637 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SF1Q15637 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SF1Q15637 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SF1Q15637 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SF1Q15637 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SF1Q15637 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SF1Q15637 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SF1Q15637 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
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