Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SIX1Q15475 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SIX1Q15475 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SIX1Q15475 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SIX1Q15475 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SIX1Q15475 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SIX1Q15475 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SIX1Q15475 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SIX1Q15475 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SIX1Q15475 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SIX1Q15475 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
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