Protein–RNA interactions for Protein: Q15004

PCLAF, PCNA-associated factor, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCLAFQ15004 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PCLAFQ15004 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
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