Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SMCO1Q147U7 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SMCO1Q147U7 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms