Protein–RNA interactions for Protein: Q14761

PTPRCAP, Protein tyrosine phosphatase receptor type C-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAPQ14761 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPRCAPQ14761 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPRCAPQ14761 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPRCAPQ14761 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPRCAPQ14761 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPRCAPQ14761 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPRCAPQ14761 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPRCAPQ14761 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPRCAPQ14761 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPRCAPQ14761 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPRCAPQ14761 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPRCAPQ14761 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPRCAPQ14761 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPRCAPQ14761 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPRCAPQ14761 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPRCAPQ14761 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPRCAPQ14761 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPRCAPQ14761 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPRCAPQ14761 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPRCAPQ14761 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPRCAPQ14761 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPRCAPQ14761 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPRCAPQ14761 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPRCAPQ14761 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPRCAPQ14761 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPRCAPQ14761 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPRCAPQ14761 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPRCAPQ14761 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPRCAPQ14761 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPRCAPQ14761 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPRCAPQ14761 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPRCAPQ14761 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PTPRCAPQ14761 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRCAPQ14761 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRCAPQ14761 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRCAPQ14761 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRCAPQ14761 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRCAPQ14761 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRCAPQ14761 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRCAPQ14761 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRCAPQ14761 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRCAPQ14761 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRCAPQ14761 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRCAPQ14761 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRCAPQ14761 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRCAPQ14761 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRCAPQ14761 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRCAPQ14761 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRCAPQ14761 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRCAPQ14761 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRCAPQ14761 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRCAPQ14761 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRCAPQ14761 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRCAPQ14761 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRCAPQ14761 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRCAPQ14761 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRCAPQ14761 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRCAPQ14761 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRCAPQ14761 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRCAPQ14761 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRCAPQ14761 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRCAPQ14761 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRCAPQ14761 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRCAPQ14761 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRCAPQ14761 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRCAPQ14761 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRCAPQ14761 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRCAPQ14761 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRCAPQ14761 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PTPRCAPQ14761 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPRCAPQ14761 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPRCAPQ14761 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPRCAPQ14761 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPRCAPQ14761 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPRCAPQ14761 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPRCAPQ14761 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPRCAPQ14761 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPRCAPQ14761 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPRCAPQ14761 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPRCAPQ14761 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPRCAPQ14761 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPRCAPQ14761 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPRCAPQ14761 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPRCAPQ14761 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPRCAPQ14761 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPRCAPQ14761 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPRCAPQ14761 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPRCAPQ14761 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPRCAPQ14761 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPRCAPQ14761 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPRCAPQ14761 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPRCAPQ14761 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPRCAPQ14761 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPRCAPQ14761 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPRCAPQ14761 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPRCAPQ14761 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPRCAPQ14761 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPRCAPQ14761 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPRCAPQ14761 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PTPRCAPQ14761 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms