Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSPNQ14714 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSPNQ14714 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SSPNQ14714 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSPNQ14714 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSPNQ14714 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSPNQ14714 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSPNQ14714 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSPNQ14714 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSPNQ14714 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSPNQ14714 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSPNQ14714 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSPNQ14714 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SSPNQ14714 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SSPNQ14714 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SSPNQ14714 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SSPNQ14714 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SSPNQ14714 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SSPNQ14714 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SSPNQ14714 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SSPNQ14714 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SSPNQ14714 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SSPNQ14714 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SSPNQ14714 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SSPNQ14714 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SSPNQ14714 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SSPNQ14714 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SSPNQ14714 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SSPNQ14714 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SSPNQ14714 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SSPNQ14714 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SSPNQ14714 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SSPNQ14714 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SSPNQ14714 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SSPNQ14714 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SSPNQ14714 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SSPNQ14714 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SSPNQ14714 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SSPNQ14714 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SSPNQ14714 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SSPNQ14714 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SSPNQ14714 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SSPNQ14714 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SSPNQ14714 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SSPNQ14714 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SSPNQ14714 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SSPNQ14714 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SSPNQ14714 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SSPNQ14714 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SSPNQ14714 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SSPNQ14714 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SSPNQ14714 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SSPNQ14714 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SSPNQ14714 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SSPNQ14714 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SSPNQ14714 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SSPNQ14714 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SSPNQ14714 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SSPNQ14714 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SSPNQ14714 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SSPNQ14714 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SSPNQ14714 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SSPNQ14714 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SSPNQ14714 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SSPNQ14714 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SSPNQ14714 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SSPNQ14714 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SSPNQ14714 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SSPNQ14714 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SSPNQ14714 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SSPNQ14714 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SSPNQ14714 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SSPNQ14714 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SSPNQ14714 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SSPNQ14714 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SSPNQ14714 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SSPNQ14714 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SSPNQ14714 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SSPNQ14714 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SSPNQ14714 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SSPNQ14714 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SSPNQ14714 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SSPNQ14714 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SSPNQ14714 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SSPNQ14714 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SSPNQ14714 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SSPNQ14714 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SSPNQ14714 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SSPNQ14714 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SSPNQ14714 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SSPNQ14714 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SSPNQ14714 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SSPNQ14714 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SSPNQ14714 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SSPNQ14714 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SSPNQ14714 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SSPNQ14714 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SSPNQ14714 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SSPNQ14714 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SSPNQ14714 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms