Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNGB1Q14028 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNGB1Q14028 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNGB1Q14028 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNGB1Q14028 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNGB1Q14028 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNGB1Q14028 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNGB1Q14028 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNGB1Q14028 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNGB1Q14028 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNGB1Q14028 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNGB1Q14028 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNGB1Q14028 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNGB1Q14028 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNGB1Q14028 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNGB1Q14028 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNGB1Q14028 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNGB1Q14028 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNGB1Q14028 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNGB1Q14028 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNGB1Q14028 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNGB1Q14028 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNGB1Q14028 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNGB1Q14028 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNGB1Q14028 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNGB1Q14028 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CNGB1Q14028 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNGB1Q14028 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNGB1Q14028 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNGB1Q14028 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNGB1Q14028 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNGB1Q14028 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNGB1Q14028 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNGB1Q14028 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNGB1Q14028 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNGB1Q14028 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNGB1Q14028 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CNGB1Q14028 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNGB1Q14028 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNGB1Q14028 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNGB1Q14028 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNGB1Q14028 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNGB1Q14028 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNGB1Q14028 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNGB1Q14028 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNGB1Q14028 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNGB1Q14028 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNGB1Q14028 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNGB1Q14028 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNGB1Q14028 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNGB1Q14028 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNGB1Q14028 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNGB1Q14028 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNGB1Q14028 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNGB1Q14028 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNGB1Q14028 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNGB1Q14028 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNGB1Q14028 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNGB1Q14028 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNGB1Q14028 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNGB1Q14028 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNGB1Q14028 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNGB1Q14028 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNGB1Q14028 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNGB1Q14028 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNGB1Q14028 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CNGB1Q14028 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNGB1Q14028 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNGB1Q14028 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNGB1Q14028 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNGB1Q14028 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNGB1Q14028 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNGB1Q14028 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CNGB1Q14028 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNGB1Q14028 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNGB1Q14028 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNGB1Q14028 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNGB1Q14028 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNGB1Q14028 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CNGB1Q14028 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CNGB1Q14028 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CNGB1Q14028 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNGB1Q14028 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CNGB1Q14028 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNGB1Q14028 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNGB1Q14028 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNGB1Q14028 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNGB1Q14028 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNGB1Q14028 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNGB1Q14028 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNGB1Q14028 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNGB1Q14028 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNGB1Q14028 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNGB1Q14028 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNGB1Q14028 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNGB1Q14028 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNGB1Q14028 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNGB1Q14028 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNGB1Q14028 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNGB1Q14028 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms