Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CDK13Q14004 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CDK13Q14004 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CDK13Q14004 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CDK13Q14004 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CDK13Q14004 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CDK13Q14004 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CDK13Q14004 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CDK13Q14004 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDK13Q14004 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDK13Q14004 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDK13Q14004 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDK13Q14004 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDK13Q14004 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CDK13Q14004 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CDK13Q14004 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDK13Q14004 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDK13Q14004 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDK13Q14004 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CDK13Q14004 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDK13Q14004 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CDK13Q14004 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CDK13Q14004 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDK13Q14004 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDK13Q14004 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CDK13Q14004 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CDK13Q14004 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDK13Q14004 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDK13Q14004 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDK13Q14004 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDK13Q14004 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDK13Q14004 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDK13Q14004 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDK13Q14004 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDK13Q14004 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDK13Q14004 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDK13Q14004 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDK13Q14004 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CDK13Q14004 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDK13Q14004 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDK13Q14004 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDK13Q14004 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDK13Q14004 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDK13Q14004 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDK13Q14004 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDK13Q14004 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDK13Q14004 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDK13Q14004 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDK13Q14004 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDK13Q14004 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDK13Q14004 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDK13Q14004 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDK13Q14004 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDK13Q14004 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDK13Q14004 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDK13Q14004 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDK13Q14004 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDK13Q14004 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CDK13Q14004 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDK13Q14004 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDK13Q14004 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDK13Q14004 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDK13Q14004 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDK13Q14004 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDK13Q14004 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CDK13Q14004 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CDK13Q14004 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CDK13Q14004 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CDK13Q14004 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CDK13Q14004 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CDK13Q14004 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CDK13Q14004 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CDK13Q14004 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CDK13Q14004 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CDK13Q14004 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CDK13Q14004 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CDK13Q14004 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CDK13Q14004 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CDK13Q14004 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CDK13Q14004 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CDK13Q14004 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CDK13Q14004 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDK13Q14004 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDK13Q14004 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDK13Q14004 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDK13Q14004 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDK13Q14004 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDK13Q14004 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDK13Q14004 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDK13Q14004 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CDK13Q14004 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDK13Q14004 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDK13Q14004 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CDK13Q14004 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDK13Q14004 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDK13Q14004 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CDK13Q14004 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDK13Q14004 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDK13Q14004 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
CDK13Q14004 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
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