Protein–RNA interactions for Protein: Q14003

KCNC3, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 3, humanhuman

Predictions only

Length 757 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC3Q14003 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNC3Q14003 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNC3Q14003 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNC3Q14003 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNC3Q14003 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNC3Q14003 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNC3Q14003 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNC3Q14003 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNC3Q14003 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNC3Q14003 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNC3Q14003 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNC3Q14003 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNC3Q14003 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNC3Q14003 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNC3Q14003 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNC3Q14003 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNC3Q14003 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNC3Q14003 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNC3Q14003 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNC3Q14003 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNC3Q14003 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNC3Q14003 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNC3Q14003 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNC3Q14003 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNC3Q14003 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNC3Q14003 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNC3Q14003 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
KCNC3Q14003 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNC3Q14003 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNC3Q14003 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNC3Q14003 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNC3Q14003 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNC3Q14003 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNC3Q14003 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNC3Q14003 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNC3Q14003 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNC3Q14003 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNC3Q14003 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNC3Q14003 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNC3Q14003 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNC3Q14003 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNC3Q14003 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNC3Q14003 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNC3Q14003 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNC3Q14003 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNC3Q14003 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNC3Q14003 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNC3Q14003 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNC3Q14003 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNC3Q14003 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNC3Q14003 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNC3Q14003 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNC3Q14003 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNC3Q14003 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
KCNC3Q14003 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNC3Q14003 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNC3Q14003 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNC3Q14003 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNC3Q14003 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNC3Q14003 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNC3Q14003 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNC3Q14003 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNC3Q14003 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNC3Q14003 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNC3Q14003 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNC3Q14003 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNC3Q14003 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNC3Q14003 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNC3Q14003 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNC3Q14003 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNC3Q14003 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNC3Q14003 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNC3Q14003 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNC3Q14003 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNC3Q14003 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNC3Q14003 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNC3Q14003 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNC3Q14003 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNC3Q14003 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNC3Q14003 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNC3Q14003 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNC3Q14003 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNC3Q14003 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KCNC3Q14003 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNC3Q14003 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNC3Q14003 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNC3Q14003 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNC3Q14003 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNC3Q14003 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNC3Q14003 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNC3Q14003 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNC3Q14003 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNC3Q14003 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNC3Q14003 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNC3Q14003 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNC3Q14003 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNC3Q14003 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNC3Q14003 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNC3Q14003 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KCNC3Q14003 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms