Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GTF2H3Q13889 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GTF2H3Q13889 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GTF2H3Q13889 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GTF2H3Q13889 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GTF2H3Q13889 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GTF2H3Q13889 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GTF2H3Q13889 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GTF2H3Q13889 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GTF2H3Q13889 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GTF2H3Q13889 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GTF2H3Q13889 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GTF2H3Q13889 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GTF2H3Q13889 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GTF2H3Q13889 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GTF2H3Q13889 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GTF2H3Q13889 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GTF2H3Q13889 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GTF2H3Q13889 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GTF2H3Q13889 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GTF2H3Q13889 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GTF2H3Q13889 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
GTF2H3Q13889 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GTF2H3Q13889 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GTF2H3Q13889 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GTF2H3Q13889 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GTF2H3Q13889 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GTF2H3Q13889 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
GTF2H3Q13889 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GTF2H3Q13889 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GTF2H3Q13889 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GTF2H3Q13889 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GTF2H3Q13889 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GTF2H3Q13889 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
GTF2H3Q13889 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GTF2H3Q13889 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GTF2H3Q13889 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GTF2H3Q13889 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GTF2H3Q13889 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GTF2H3Q13889 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GTF2H3Q13889 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GTF2H3Q13889 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GTF2H3Q13889 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GTF2H3Q13889 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GTF2H3Q13889 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GTF2H3Q13889 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GTF2H3Q13889 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GTF2H3Q13889 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GTF2H3Q13889 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GTF2H3Q13889 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
GTF2H3Q13889 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GTF2H3Q13889 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GTF2H3Q13889 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GTF2H3Q13889 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GTF2H3Q13889 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GTF2H3Q13889 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GTF2H3Q13889 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
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GTF2H3Q13889 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GTF2H3Q13889 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GTF2H3Q13889 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GTF2H3Q13889 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
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GTF2H3Q13889 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
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GTF2H3Q13889 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GTF2H3Q13889 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GTF2H3Q13889 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GTF2H3Q13889 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GTF2H3Q13889 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GTF2H3Q13889 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GTF2H3Q13889 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GTF2H3Q13889 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GTF2H3Q13889 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GTF2H3Q13889 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GTF2H3Q13889 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GTF2H3Q13889 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GTF2H3Q13889 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GTF2H3Q13889 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GTF2H3Q13889 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GTF2H3Q13889 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GTF2H3Q13889 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GTF2H3Q13889 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GTF2H3Q13889 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GTF2H3Q13889 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GTF2H3Q13889 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GTF2H3Q13889 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GTF2H3Q13889 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GTF2H3Q13889 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GTF2H3Q13889 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GTF2H3Q13889 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GTF2H3Q13889 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GTF2H3Q13889 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GTF2H3Q13889 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
GTF2H3Q13889 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GTF2H3Q13889 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GTF2H3Q13889 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GTF2H3Q13889 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GTF2H3Q13889 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GTF2H3Q13889 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
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