Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CUL4BQ13620 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CUL4BQ13620 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CUL4BQ13620 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CUL4BQ13620 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CUL4BQ13620 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CUL4BQ13620 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CUL4BQ13620 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CUL4BQ13620 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CUL4BQ13620 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CUL4BQ13620 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CUL4BQ13620 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CUL4BQ13620 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CUL4BQ13620 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CUL4BQ13620 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
CUL4BQ13620 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CUL4BQ13620 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
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