Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CUL4AQ13619 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CUL4AQ13619 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CUL4AQ13619 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CUL4AQ13619 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CUL4AQ13619 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CUL4AQ13619 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CUL4AQ13619 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CUL4AQ13619 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CUL4AQ13619 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CUL4AQ13619 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CUL4AQ13619 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CUL4AQ13619 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CUL4AQ13619 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CUL4AQ13619 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CUL4AQ13619 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CUL4AQ13619 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CUL4AQ13619 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.87
CUL4AQ13619 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CUL4AQ13619 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CUL4AQ13619 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CUL4AQ13619 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CUL4AQ13619 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CUL4AQ13619 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CUL4AQ13619 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CUL4AQ13619 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CUL4AQ13619 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CUL4AQ13619 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CUL4AQ13619 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CUL4AQ13619 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CUL4AQ13619 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CUL4AQ13619 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CUL4AQ13619 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CUL4AQ13619 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CUL4AQ13619 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CUL4AQ13619 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CUL4AQ13619 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CUL4AQ13619 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CUL4AQ13619 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CUL4AQ13619 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CUL4AQ13619 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CUL4AQ13619 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CUL4AQ13619 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CUL4AQ13619 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CUL4AQ13619 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CUL4AQ13619 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CUL4AQ13619 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CUL4AQ13619 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CUL4AQ13619 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CUL4AQ13619 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CUL4AQ13619 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CUL4AQ13619 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CUL4AQ13619 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CUL4AQ13619 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CUL4AQ13619 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CUL4AQ13619 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CUL4AQ13619 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CUL4AQ13619 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CUL4AQ13619 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CUL4AQ13619 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CUL4AQ13619 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CUL4AQ13619 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CUL4AQ13619 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CUL4AQ13619 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CUL4AQ13619 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CUL4AQ13619 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CUL4AQ13619 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CUL4AQ13619 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CUL4AQ13619 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CUL4AQ13619 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CUL4AQ13619 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CUL4AQ13619 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CUL4AQ13619 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CUL4AQ13619 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CUL4AQ13619 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CUL4AQ13619 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CUL4AQ13619 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CUL4AQ13619 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CUL4AQ13619 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CUL4AQ13619 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CUL4AQ13619 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CUL4AQ13619 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CUL4AQ13619 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CUL4AQ13619 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CUL4AQ13619 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CUL4AQ13619 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CUL4AQ13619 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CUL4AQ13619 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CUL4AQ13619 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CUL4AQ13619 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CUL4AQ13619 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CUL4AQ13619 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CUL4AQ13619 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CUL4AQ13619 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CUL4AQ13619 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CUL4AQ13619 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CUL4AQ13619 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CUL4AQ13619 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CUL4AQ13619 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CUL4AQ13619 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms