Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TOP3AQ13472 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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