Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LSAMPQ13449 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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