Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
AP3B2Q13367 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
AP3B2Q13367 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
AP3B2Q13367 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
AP3B2Q13367 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
AP3B2Q13367 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
AP3B2Q13367 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
AP3B2Q13367 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
AP3B2Q13367 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
AP3B2Q13367 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
AP3B2Q13367 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
AP3B2Q13367 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
AP3B2Q13367 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
AP3B2Q13367 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
AP3B2Q13367 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
AP3B2Q13367 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
AP3B2Q13367 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
AP3B2Q13367 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
AP3B2Q13367 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
AP3B2Q13367 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
AP3B2Q13367 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
AP3B2Q13367 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
AP3B2Q13367 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
AP3B2Q13367 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
AP3B2Q13367 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
AP3B2Q13367 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
AP3B2Q13367 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
AP3B2Q13367 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
AP3B2Q13367 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
AP3B2Q13367 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
AP3B2Q13367 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
AP3B2Q13367 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
AP3B2Q13367 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
AP3B2Q13367 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
AP3B2Q13367 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
AP3B2Q13367 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
AP3B2Q13367 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
AP3B2Q13367 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
AP3B2Q13367 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
AP3B2Q13367 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
AP3B2Q13367 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
AP3B2Q13367 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
AP3B2Q13367 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
AP3B2Q13367 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
AP3B2Q13367 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
AP3B2Q13367 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
AP3B2Q13367 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
AP3B2Q13367 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
AP3B2Q13367 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
AP3B2Q13367 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
AP3B2Q13367 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
AP3B2Q13367 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
AP3B2Q13367 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
AP3B2Q13367 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
AP3B2Q13367 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
AP3B2Q13367 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
AP3B2Q13367 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
AP3B2Q13367 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
AP3B2Q13367 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
AP3B2Q13367 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
AP3B2Q13367 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
AP3B2Q13367 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
AP3B2Q13367 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
AP3B2Q13367 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
AP3B2Q13367 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
AP3B2Q13367 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
AP3B2Q13367 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
AP3B2Q13367 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
AP3B2Q13367 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
AP3B2Q13367 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
AP3B2Q13367 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
AP3B2Q13367 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
AP3B2Q13367 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
AP3B2Q13367 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
AP3B2Q13367 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
AP3B2Q13367 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
AP3B2Q13367 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
AP3B2Q13367 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
AP3B2Q13367 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
AP3B2Q13367 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
AP3B2Q13367 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
AP3B2Q13367 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
AP3B2Q13367 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
AP3B2Q13367 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
AP3B2Q13367 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
AP3B2Q13367 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
AP3B2Q13367 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
AP3B2Q13367 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
AP3B2Q13367 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
AP3B2Q13367 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
AP3B2Q13367 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
AP3B2Q13367 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
AP3B2Q13367 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
AP3B2Q13367 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
AP3B2Q13367 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
AP3B2Q13367 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
AP3B2Q13367 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
AP3B2Q13367 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
AP3B2Q13367 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
AP3B2Q13367 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms