Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GPS1Q13098 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GPS1Q13098 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
GPS1Q13098 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GPS1Q13098 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPS1Q13098 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPS1Q13098 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPS1Q13098 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPS1Q13098 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPS1Q13098 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPS1Q13098 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPS1Q13098 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPS1Q13098 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GPS1Q13098 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPS1Q13098 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GPS1Q13098 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GPS1Q13098 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPS1Q13098 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPS1Q13098 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPS1Q13098 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPS1Q13098 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPS1Q13098 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPS1Q13098 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPS1Q13098 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPS1Q13098 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPS1Q13098 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPS1Q13098 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPS1Q13098 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPS1Q13098 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPS1Q13098 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPS1Q13098 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPS1Q13098 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
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