Protein–RNA interactions for Protein: Q12908

SLC10A2, Ileal sodium/bile acid cotransporter, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A2Q12908 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC10A2Q12908 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC10A2Q12908 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC10A2Q12908 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC10A2Q12908 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC10A2Q12908 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC10A2Q12908 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC10A2Q12908 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC10A2Q12908 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC10A2Q12908 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC10A2Q12908 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC10A2Q12908 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC10A2Q12908 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC10A2Q12908 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC10A2Q12908 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC10A2Q12908 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC10A2Q12908 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC10A2Q12908 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC10A2Q12908 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC10A2Q12908 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC10A2Q12908 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC10A2Q12908 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC10A2Q12908 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC10A2Q12908 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC10A2Q12908 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC10A2Q12908 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC10A2Q12908 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC10A2Q12908 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC10A2Q12908 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC10A2Q12908 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC10A2Q12908 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC10A2Q12908 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC10A2Q12908 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC10A2Q12908 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC10A2Q12908 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC10A2Q12908 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC10A2Q12908 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC10A2Q12908 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC10A2Q12908 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC10A2Q12908 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC10A2Q12908 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC10A2Q12908 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC10A2Q12908 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC10A2Q12908 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC10A2Q12908 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC10A2Q12908 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC10A2Q12908 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC10A2Q12908 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC10A2Q12908 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC10A2Q12908 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC10A2Q12908 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC10A2Q12908 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC10A2Q12908 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC10A2Q12908 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC10A2Q12908 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC10A2Q12908 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC10A2Q12908 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC10A2Q12908 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC10A2Q12908 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC10A2Q12908 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC10A2Q12908 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC10A2Q12908 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC10A2Q12908 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC10A2Q12908 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC10A2Q12908 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC10A2Q12908 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC10A2Q12908 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC10A2Q12908 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC10A2Q12908 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC10A2Q12908 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC10A2Q12908 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC10A2Q12908 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC10A2Q12908 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC10A2Q12908 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC10A2Q12908 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC10A2Q12908 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC10A2Q12908 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC10A2Q12908 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC10A2Q12908 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC10A2Q12908 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC10A2Q12908 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC10A2Q12908 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC10A2Q12908 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC10A2Q12908 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC10A2Q12908 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC10A2Q12908 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC10A2Q12908 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC10A2Q12908 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC10A2Q12908 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC10A2Q12908 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC10A2Q12908 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC10A2Q12908 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC10A2Q12908 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC10A2Q12908 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC10A2Q12908 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC10A2Q12908 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC10A2Q12908 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC10A2Q12908 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC10A2Q12908 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC10A2Q12908 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms