Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BPTFQ12830 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BPTFQ12830 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BPTFQ12830 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BPTFQ12830 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BPTFQ12830 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BPTFQ12830 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BPTFQ12830 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BPTFQ12830 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BPTFQ12830 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BPTFQ12830 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
BPTFQ12830 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BPTFQ12830 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BPTFQ12830 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BPTFQ12830 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BPTFQ12830 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BPTFQ12830 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BPTFQ12830 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BPTFQ12830 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
BPTFQ12830 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BPTFQ12830 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BPTFQ12830 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BPTFQ12830 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BPTFQ12830 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BPTFQ12830 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BPTFQ12830 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BPTFQ12830 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BPTFQ12830 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BPTFQ12830 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BPTFQ12830 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BPTFQ12830 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BPTFQ12830 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BPTFQ12830 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BPTFQ12830 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
BPTFQ12830 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BPTFQ12830 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BPTFQ12830 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BPTFQ12830 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BPTFQ12830 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BPTFQ12830 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BPTFQ12830 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
BPTFQ12830 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BPTFQ12830 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BPTFQ12830 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BPTFQ12830 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BPTFQ12830 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BPTFQ12830 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BPTFQ12830 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BPTFQ12830 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BPTFQ12830 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BPTFQ12830 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BPTFQ12830 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BPTFQ12830 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BPTFQ12830 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BPTFQ12830 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BPTFQ12830 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
BPTFQ12830 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BPTFQ12830 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BPTFQ12830 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BPTFQ12830 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BPTFQ12830 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BPTFQ12830 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BPTFQ12830 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BPTFQ12830 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BPTFQ12830 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BPTFQ12830 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BPTFQ12830 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BPTFQ12830 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BPTFQ12830 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BPTFQ12830 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BPTFQ12830 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BPTFQ12830 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BPTFQ12830 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BPTFQ12830 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BPTFQ12830 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BPTFQ12830 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BPTFQ12830 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BPTFQ12830 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BPTFQ12830 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
BPTFQ12830 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BPTFQ12830 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BPTFQ12830 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BPTFQ12830 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BPTFQ12830 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BPTFQ12830 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BPTFQ12830 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BPTFQ12830 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BPTFQ12830 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BPTFQ12830 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BPTFQ12830 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BPTFQ12830 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BPTFQ12830 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BPTFQ12830 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BPTFQ12830 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BPTFQ12830 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BPTFQ12830 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BPTFQ12830 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BPTFQ12830 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BPTFQ12830 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BPTFQ12830 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
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