Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KCNMA1Q12791 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KCNMA1Q12791 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KCNMA1Q12791 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KCNMA1Q12791 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
KCNMA1Q12791 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KCNMA1Q12791 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KCNMA1Q12791 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
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KCNMA1Q12791 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
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KCNMA1Q12791 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KCNMA1Q12791 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KCNMA1Q12791 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
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KCNMA1Q12791 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KCNMA1Q12791 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
KCNMA1Q12791 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
KCNMA1Q12791 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KCNMA1Q12791 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KCNMA1Q12791 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KCNMA1Q12791 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KCNMA1Q12791 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KCNMA1Q12791 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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KCNMA1Q12791 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KCNMA1Q12791 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KCNMA1Q12791 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KCNMA1Q12791 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KCNMA1Q12791 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KCNMA1Q12791 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KCNMA1Q12791 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KCNMA1Q12791 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KCNMA1Q12791 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KCNMA1Q12791 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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KCNMA1Q12791 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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KCNMA1Q12791 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
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KCNMA1Q12791 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KCNMA1Q12791 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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KCNMA1Q12791 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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KCNMA1Q12791 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
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KCNMA1Q12791 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
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KCNMA1Q12791 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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KCNMA1Q12791 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KCNMA1Q12791 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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KCNMA1Q12791 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KCNMA1Q12791 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KCNMA1Q12791 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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KCNMA1Q12791 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KCNMA1Q12791 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KCNMA1Q12791 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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KCNMA1Q12791 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KCNMA1Q12791 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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KCNMA1Q12791 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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KCNMA1Q12791 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KCNMA1Q12791 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
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KCNMA1Q12791 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KCNMA1Q12791 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
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