Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC15Q0P6D6 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC15Q0P6D6 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC15Q0P6D6 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC15Q0P6D6 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC15Q0P6D6 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC15Q0P6D6 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC15Q0P6D6 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC15Q0P6D6 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC15Q0P6D6 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC15Q0P6D6 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC15Q0P6D6 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC15Q0P6D6 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC15Q0P6D6 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC15Q0P6D6 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC15Q0P6D6 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC15Q0P6D6 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC15Q0P6D6 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC15Q0P6D6 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC15Q0P6D6 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC15Q0P6D6 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC15Q0P6D6 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC15Q0P6D6 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC15Q0P6D6 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC15Q0P6D6 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC15Q0P6D6 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC15Q0P6D6 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC15Q0P6D6 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC15Q0P6D6 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC15Q0P6D6 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC15Q0P6D6 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC15Q0P6D6 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC15Q0P6D6 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC15Q0P6D6 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC15Q0P6D6 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC15Q0P6D6 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC15Q0P6D6 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC15Q0P6D6 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC15Q0P6D6 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC15Q0P6D6 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC15Q0P6D6 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC15Q0P6D6 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC15Q0P6D6 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC15Q0P6D6 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC15Q0P6D6 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC15Q0P6D6 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC15Q0P6D6 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC15Q0P6D6 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC15Q0P6D6 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC15Q0P6D6 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC15Q0P6D6 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC15Q0P6D6 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC15Q0P6D6 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC15Q0P6D6 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC15Q0P6D6 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC15Q0P6D6 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC15Q0P6D6 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC15Q0P6D6 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC15Q0P6D6 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC15Q0P6D6 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC15Q0P6D6 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC15Q0P6D6 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC15Q0P6D6 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC15Q0P6D6 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC15Q0P6D6 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC15Q0P6D6 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC15Q0P6D6 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC15Q0P6D6 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC15Q0P6D6 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC15Q0P6D6 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC15Q0P6D6 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC15Q0P6D6 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC15Q0P6D6 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC15Q0P6D6 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC15Q0P6D6 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC15Q0P6D6 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC15Q0P6D6 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC15Q0P6D6 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC15Q0P6D6 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC15Q0P6D6 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC15Q0P6D6 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC15Q0P6D6 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC15Q0P6D6 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC15Q0P6D6 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC15Q0P6D6 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC15Q0P6D6 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC15Q0P6D6 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC15Q0P6D6 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC15Q0P6D6 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC15Q0P6D6 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC15Q0P6D6 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC15Q0P6D6 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC15Q0P6D6 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC15Q0P6D6 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC15Q0P6D6 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC15Q0P6D6 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC15Q0P6D6 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC15Q0P6D6 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC15Q0P6D6 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC15Q0P6D6 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms