Protein–RNA interactions for Protein: Q08378

GOLGA3, Golgin subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA3Q08378 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GOLGA3Q08378 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GOLGA3Q08378 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
GOLGA3Q08378 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GOLGA3Q08378 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
GOLGA3Q08378 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GOLGA3Q08378 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
GOLGA3Q08378 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
GOLGA3Q08378 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
GOLGA3Q08378 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GOLGA3Q08378 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GOLGA3Q08378 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
GOLGA3Q08378 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
GOLGA3Q08378 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
GOLGA3Q08378 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GOLGA3Q08378 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GOLGA3Q08378 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GOLGA3Q08378 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
GOLGA3Q08378 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
GOLGA3Q08378 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GOLGA3Q08378 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
GOLGA3Q08378 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
GOLGA3Q08378 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
GOLGA3Q08378 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
GOLGA3Q08378 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GOLGA3Q08378 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
GOLGA3Q08378 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
GOLGA3Q08378 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
GOLGA3Q08378 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
GOLGA3Q08378 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
GOLGA3Q08378 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
GOLGA3Q08378 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
GOLGA3Q08378 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
GOLGA3Q08378 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
GOLGA3Q08378 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC28.17■■■□□ 2.1
GOLGA3Q08378 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
GOLGA3Q08378 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
GOLGA3Q08378 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
GOLGA3Q08378 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
GOLGA3Q08378 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
GOLGA3Q08378 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
GOLGA3Q08378 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
GOLGA3Q08378 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
GOLGA3Q08378 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
GOLGA3Q08378 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
GOLGA3Q08378 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
GOLGA3Q08378 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
GOLGA3Q08378 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GOLGA3Q08378 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GOLGA3Q08378 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GOLGA3Q08378 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GOLGA3Q08378 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GOLGA3Q08378 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC28.16■■■□□ 2.1
GOLGA3Q08378 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
GOLGA3Q08378 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
GOLGA3Q08378 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GOLGA3Q08378 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GOLGA3Q08378 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GOLGA3Q08378 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GOLGA3Q08378 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GOLGA3Q08378 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
GOLGA3Q08378 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GOLGA3Q08378 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GOLGA3Q08378 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GOLGA3Q08378 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GOLGA3Q08378 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GOLGA3Q08378 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GOLGA3Q08378 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GOLGA3Q08378 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GOLGA3Q08378 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GOLGA3Q08378 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GOLGA3Q08378 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GOLGA3Q08378 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GOLGA3Q08378 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
GOLGA3Q08378 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GOLGA3Q08378 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GOLGA3Q08378 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GOLGA3Q08378 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GOLGA3Q08378 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GOLGA3Q08378 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GOLGA3Q08378 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GOLGA3Q08378 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GOLGA3Q08378 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GOLGA3Q08378 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GOLGA3Q08378 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
GOLGA3Q08378 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GOLGA3Q08378 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
GOLGA3Q08378 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
GOLGA3Q08378 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
GOLGA3Q08378 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
GOLGA3Q08378 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
GOLGA3Q08378 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
GOLGA3Q08378 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
GOLGA3Q08378 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
GOLGA3Q08378 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
GOLGA3Q08378 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
GOLGA3Q08378 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
GOLGA3Q08378 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
GOLGA3Q08378 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GOLGA3Q08378 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms