Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CTDSPL2Q05D32 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CTDSPL2Q05D32 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CTDSPL2Q05D32 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CTDSPL2Q05D32 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CTDSPL2Q05D32 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CTDSPL2Q05D32 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CTDSPL2Q05D32 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CTDSPL2Q05D32 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CTDSPL2Q05D32 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CTDSPL2Q05D32 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CTDSPL2Q05D32 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CTDSPL2Q05D32 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CTDSPL2Q05D32 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CTDSPL2Q05D32 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CTDSPL2Q05D32 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CTDSPL2Q05D32 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CTDSPL2Q05D32 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CTDSPL2Q05D32 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CTDSPL2Q05D32 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CTDSPL2Q05D32 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CTDSPL2Q05D32 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CTDSPL2Q05D32 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CTDSPL2Q05D32 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
CTDSPL2Q05D32 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CTDSPL2Q05D32 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CTDSPL2Q05D32 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CTDSPL2Q05D32 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CTDSPL2Q05D32 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CTDSPL2Q05D32 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CTDSPL2Q05D32 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CTDSPL2Q05D32 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CTDSPL2Q05D32 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CTDSPL2Q05D32 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
CTDSPL2Q05D32 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CTDSPL2Q05D32 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CTDSPL2Q05D32 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CTDSPL2Q05D32 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CTDSPL2Q05D32 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CTDSPL2Q05D32 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CTDSPL2Q05D32 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CTDSPL2Q05D32 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CTDSPL2Q05D32 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CTDSPL2Q05D32 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CTDSPL2Q05D32 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CTDSPL2Q05D32 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CTDSPL2Q05D32 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CTDSPL2Q05D32 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CTDSPL2Q05D32 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CTDSPL2Q05D32 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CTDSPL2Q05D32 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CTDSPL2Q05D32 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CTDSPL2Q05D32 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
CTDSPL2Q05D32 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CTDSPL2Q05D32 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CTDSPL2Q05D32 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CTDSPL2Q05D32 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
CTDSPL2Q05D32 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CTDSPL2Q05D32 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
CTDSPL2Q05D32 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CTDSPL2Q05D32 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CTDSPL2Q05D32 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CTDSPL2Q05D32 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CTDSPL2Q05D32 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
CTDSPL2Q05D32 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CTDSPL2Q05D32 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CTDSPL2Q05D32 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CTDSPL2Q05D32 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CTDSPL2Q05D32 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CTDSPL2Q05D32 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CTDSPL2Q05D32 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CTDSPL2Q05D32 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CTDSPL2Q05D32 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CTDSPL2Q05D32 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CTDSPL2Q05D32 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CTDSPL2Q05D32 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CTDSPL2Q05D32 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CTDSPL2Q05D32 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CTDSPL2Q05D32 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CTDSPL2Q05D32 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CTDSPL2Q05D32 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CTDSPL2Q05D32 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
CTDSPL2Q05D32 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
CTDSPL2Q05D32 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CTDSPL2Q05D32 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
CTDSPL2Q05D32 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CTDSPL2Q05D32 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
CTDSPL2Q05D32 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CTDSPL2Q05D32 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
CTDSPL2Q05D32 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CTDSPL2Q05D32 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CTDSPL2Q05D32 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CTDSPL2Q05D32 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CTDSPL2Q05D32 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CTDSPL2Q05D32 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CTDSPL2Q05D32 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CTDSPL2Q05D32 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CTDSPL2Q05D32 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CTDSPL2Q05D32 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CTDSPL2Q05D32 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms