Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 LINC02347-203ENST00000540774 1442 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 PLSCR2-201ENST00000336685 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 EIF2S2P3-201ENST00000428356 999 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 AC005534.1-201ENST00000455709 742 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 AL365223.1-201ENST00000574864 1297 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
TNP2Q05952 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms