Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC17■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IRF8Q02556 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms