Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DSC2Q02487 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms