Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CENPEQ02224 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CENPEQ02224 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.4 ms