Protein–RNA interactions for Protein: Q01892

SPIB, Transcription factor Spi-B, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIBQ01892 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPIBQ01892 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SPIBQ01892 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SPIBQ01892 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SPIBQ01892 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SPIBQ01892 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SPIBQ01892 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SPIBQ01892 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SPIBQ01892 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SPIBQ01892 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SPIBQ01892 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SPIBQ01892 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SPIBQ01892 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SPIBQ01892 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SPIBQ01892 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SPIBQ01892 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SPIBQ01892 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SPIBQ01892 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SPIBQ01892 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SPIBQ01892 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPIBQ01892 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPIBQ01892 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPIBQ01892 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPIBQ01892 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPIBQ01892 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPIBQ01892 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPIBQ01892 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPIBQ01892 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPIBQ01892 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPIBQ01892 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPIBQ01892 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms