Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IFITM3Q01628 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms