Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
MS4A2Q01362 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MS4A2Q01362 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms