Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT1

PRCD, Progressive rod-cone degeneration protein, humanhuman

Predictions only

Length 54 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRCDQ00LT1 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
PRCDQ00LT1 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PRCDQ00LT1 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
PRCDQ00LT1 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
PRCDQ00LT1 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PRCDQ00LT1 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PRCDQ00LT1 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
PRCDQ00LT1 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PRCDQ00LT1 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PRCDQ00LT1 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
PRCDQ00LT1 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PRCDQ00LT1 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
PRCDQ00LT1 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PRCDQ00LT1 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PRCDQ00LT1 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PRCDQ00LT1 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PRCDQ00LT1 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PRCDQ00LT1 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PRCDQ00LT1 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PRCDQ00LT1 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PRCDQ00LT1 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PRCDQ00LT1 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PRCDQ00LT1 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PRCDQ00LT1 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PRCDQ00LT1 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PRCDQ00LT1 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PRCDQ00LT1 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PRCDQ00LT1 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PRCDQ00LT1 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PRCDQ00LT1 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PRCDQ00LT1 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PRCDQ00LT1 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PRCDQ00LT1 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PRCDQ00LT1 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PRCDQ00LT1 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PRCDQ00LT1 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PRCDQ00LT1 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PRCDQ00LT1 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PRCDQ00LT1 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PRCDQ00LT1 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PRCDQ00LT1 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PRCDQ00LT1 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
PRCDQ00LT1 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PRCDQ00LT1 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
PRCDQ00LT1 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PRCDQ00LT1 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PRCDQ00LT1 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PRCDQ00LT1 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PRCDQ00LT1 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PRCDQ00LT1 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PRCDQ00LT1 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PRCDQ00LT1 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PRCDQ00LT1 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PRCDQ00LT1 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PRCDQ00LT1 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PRCDQ00LT1 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PRCDQ00LT1 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PRCDQ00LT1 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PRCDQ00LT1 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PRCDQ00LT1 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PRCDQ00LT1 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PRCDQ00LT1 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PRCDQ00LT1 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PRCDQ00LT1 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PRCDQ00LT1 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PRCDQ00LT1 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PRCDQ00LT1 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PRCDQ00LT1 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PRCDQ00LT1 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PRCDQ00LT1 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PRCDQ00LT1 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PRCDQ00LT1 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PRCDQ00LT1 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PRCDQ00LT1 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PRCDQ00LT1 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PRCDQ00LT1 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PRCDQ00LT1 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PRCDQ00LT1 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PRCDQ00LT1 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PRCDQ00LT1 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PRCDQ00LT1 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PRCDQ00LT1 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PRCDQ00LT1 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PRCDQ00LT1 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PRCDQ00LT1 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PRCDQ00LT1 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PRCDQ00LT1 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PRCDQ00LT1 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PRCDQ00LT1 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PRCDQ00LT1 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PRCDQ00LT1 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PRCDQ00LT1 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PRCDQ00LT1 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
PRCDQ00LT1 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
PRCDQ00LT1 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PRCDQ00LT1 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PRCDQ00LT1 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PRCDQ00LT1 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PRCDQ00LT1 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PRCDQ00LT1 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms