Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
IRF9Q00978 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms