Protein–RNA interactions for Protein: Q00534

CDK6, Cyclin-dependent kinase 6, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK6Q00534 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDK6Q00534 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms