Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXC5Q00444 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXC5Q00444 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXC5Q00444 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXC5Q00444 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXC5Q00444 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXC5Q00444 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXC5Q00444 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXC5Q00444 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXC5Q00444 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXC5Q00444 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXC5Q00444 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXC5Q00444 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXC5Q00444 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXC5Q00444 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXC5Q00444 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXC5Q00444 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXC5Q00444 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXC5Q00444 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXC5Q00444 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXC5Q00444 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXC5Q00444 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXC5Q00444 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXC5Q00444 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXC5Q00444 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXC5Q00444 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXC5Q00444 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXC5Q00444 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXC5Q00444 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXC5Q00444 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXC5Q00444 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXC5Q00444 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXC5Q00444 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXC5Q00444 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXC5Q00444 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXC5Q00444 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXC5Q00444 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXC5Q00444 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXC5Q00444 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXC5Q00444 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXC5Q00444 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXC5Q00444 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXC5Q00444 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXC5Q00444 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXC5Q00444 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXC5Q00444 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXC5Q00444 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXC5Q00444 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXC5Q00444 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXC5Q00444 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXC5Q00444 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXC5Q00444 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXC5Q00444 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXC5Q00444 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXC5Q00444 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXC5Q00444 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXC5Q00444 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXC5Q00444 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXC5Q00444 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXC5Q00444 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXC5Q00444 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXC5Q00444 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXC5Q00444 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXC5Q00444 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXC5Q00444 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXC5Q00444 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXC5Q00444 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXC5Q00444 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXC5Q00444 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXC5Q00444 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXC5Q00444 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXC5Q00444 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXC5Q00444 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXC5Q00444 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXC5Q00444 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXC5Q00444 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXC5Q00444 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXC5Q00444 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXC5Q00444 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXC5Q00444 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXC5Q00444 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXC5Q00444 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXC5Q00444 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXC5Q00444 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXC5Q00444 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXC5Q00444 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXC5Q00444 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXC5Q00444 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXC5Q00444 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXC5Q00444 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXC5Q00444 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXC5Q00444 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXC5Q00444 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXC5Q00444 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXC5Q00444 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXC5Q00444 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXC5Q00444 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXC5Q00444 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXC5Q00444 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXC5Q00444 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.9 ms