Protein–RNA interactions for Protein: P62820

RAB1A, Ras-related protein Rab-1A, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB1AP62820 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms