Protein–RNA interactions for Protein: P57078

RIPK4, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPK4P57078 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RIPK4P57078 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RIPK4P57078 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RIPK4P57078 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RIPK4P57078 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RIPK4P57078 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RIPK4P57078 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RIPK4P57078 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RIPK4P57078 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RIPK4P57078 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RIPK4P57078 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RIPK4P57078 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RIPK4P57078 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RIPK4P57078 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RIPK4P57078 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RIPK4P57078 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RIPK4P57078 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RIPK4P57078 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RIPK4P57078 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RIPK4P57078 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RIPK4P57078 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RIPK4P57078 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RIPK4P57078 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RIPK4P57078 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RIPK4P57078 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RIPK4P57078 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RIPK4P57078 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RIPK4P57078 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RIPK4P57078 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RIPK4P57078 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RIPK4P57078 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RIPK4P57078 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RIPK4P57078 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RIPK4P57078 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RIPK4P57078 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RIPK4P57078 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RIPK4P57078 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RIPK4P57078 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RIPK4P57078 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RIPK4P57078 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RIPK4P57078 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RIPK4P57078 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RIPK4P57078 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RIPK4P57078 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RIPK4P57078 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RIPK4P57078 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RIPK4P57078 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RIPK4P57078 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RIPK4P57078 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RIPK4P57078 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RIPK4P57078 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RIPK4P57078 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RIPK4P57078 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RIPK4P57078 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RIPK4P57078 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RIPK4P57078 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
RIPK4P57078 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RIPK4P57078 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
RIPK4P57078 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RIPK4P57078 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RIPK4P57078 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RIPK4P57078 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RIPK4P57078 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RIPK4P57078 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RIPK4P57078 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RIPK4P57078 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RIPK4P57078 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RIPK4P57078 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RIPK4P57078 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RIPK4P57078 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RIPK4P57078 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RIPK4P57078 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RIPK4P57078 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RIPK4P57078 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RIPK4P57078 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RIPK4P57078 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RIPK4P57078 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RIPK4P57078 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RIPK4P57078 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RIPK4P57078 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RIPK4P57078 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RIPK4P57078 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RIPK4P57078 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RIPK4P57078 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RIPK4P57078 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RIPK4P57078 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RIPK4P57078 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RIPK4P57078 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RIPK4P57078 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RIPK4P57078 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RIPK4P57078 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RIPK4P57078 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RIPK4P57078 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RIPK4P57078 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RIPK4P57078 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RIPK4P57078 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RIPK4P57078 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RIPK4P57078 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RIPK4P57078 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RIPK4P57078 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms