Protein–RNA interactions for Protein: P56597

NME5, Nucleoside diphosphate kinase homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME5P56597 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
NME5P56597 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NME5P56597 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NME5P56597 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NME5P56597 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NME5P56597 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NME5P56597 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NME5P56597 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NME5P56597 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NME5P56597 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NME5P56597 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NME5P56597 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NME5P56597 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NME5P56597 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NME5P56597 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NME5P56597 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NME5P56597 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NME5P56597 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NME5P56597 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NME5P56597 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NME5P56597 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NME5P56597 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NME5P56597 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NME5P56597 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NME5P56597 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NME5P56597 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NME5P56597 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NME5P56597 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NME5P56597 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NME5P56597 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NME5P56597 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
NME5P56597 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NME5P56597 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
NME5P56597 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NME5P56597 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NME5P56597 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NME5P56597 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NME5P56597 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NME5P56597 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NME5P56597 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NME5P56597 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NME5P56597 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
NME5P56597 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NME5P56597 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NME5P56597 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
NME5P56597 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NME5P56597 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NME5P56597 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NME5P56597 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NME5P56597 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NME5P56597 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NME5P56597 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NME5P56597 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NME5P56597 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NME5P56597 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NME5P56597 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NME5P56597 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NME5P56597 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NME5P56597 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NME5P56597 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NME5P56597 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NME5P56597 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NME5P56597 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NME5P56597 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NME5P56597 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NME5P56597 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NME5P56597 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NME5P56597 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NME5P56597 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NME5P56597 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NME5P56597 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NME5P56597 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NME5P56597 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NME5P56597 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NME5P56597 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NME5P56597 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NME5P56597 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NME5P56597 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NME5P56597 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NME5P56597 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NME5P56597 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NME5P56597 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NME5P56597 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NME5P56597 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NME5P56597 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NME5P56597 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NME5P56597 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NME5P56597 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NME5P56597 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NME5P56597 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NME5P56597 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NME5P56597 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NME5P56597 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NME5P56597 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NME5P56597 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NME5P56597 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NME5P56597 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NME5P56597 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NME5P56597 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NME5P56597 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms