Protein–RNA interactions for Protein: P55854

SUMO3, Small ubiquitin-related modifier 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO3P55854 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SUMO3P55854 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SUMO3P55854 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SUMO3P55854 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SUMO3P55854 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SUMO3P55854 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SUMO3P55854 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SUMO3P55854 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SUMO3P55854 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SUMO3P55854 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SUMO3P55854 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SUMO3P55854 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SUMO3P55854 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SUMO3P55854 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SUMO3P55854 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SUMO3P55854 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SUMO3P55854 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SUMO3P55854 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SUMO3P55854 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SUMO3P55854 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SUMO3P55854 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SUMO3P55854 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SUMO3P55854 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SUMO3P55854 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SUMO3P55854 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SUMO3P55854 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SUMO3P55854 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SUMO3P55854 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SUMO3P55854 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SUMO3P55854 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SUMO3P55854 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SUMO3P55854 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SUMO3P55854 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SUMO3P55854 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SUMO3P55854 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SUMO3P55854 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SUMO3P55854 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SUMO3P55854 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SUMO3P55854 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SUMO3P55854 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SUMO3P55854 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SUMO3P55854 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SUMO3P55854 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SUMO3P55854 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SUMO3P55854 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SUMO3P55854 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SUMO3P55854 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SUMO3P55854 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SUMO3P55854 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SUMO3P55854 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SUMO3P55854 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SUMO3P55854 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SUMO3P55854 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SUMO3P55854 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SUMO3P55854 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SUMO3P55854 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SUMO3P55854 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SUMO3P55854 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SUMO3P55854 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SUMO3P55854 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SUMO3P55854 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SUMO3P55854 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SUMO3P55854 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SUMO3P55854 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SUMO3P55854 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SUMO3P55854 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SUMO3P55854 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SUMO3P55854 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SUMO3P55854 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SUMO3P55854 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SUMO3P55854 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SUMO3P55854 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SUMO3P55854 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SUMO3P55854 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SUMO3P55854 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SUMO3P55854 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SUMO3P55854 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SUMO3P55854 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SUMO3P55854 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SUMO3P55854 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SUMO3P55854 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SUMO3P55854 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SUMO3P55854 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SUMO3P55854 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SUMO3P55854 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SUMO3P55854 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SUMO3P55854 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SUMO3P55854 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SUMO3P55854 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SUMO3P55854 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SUMO3P55854 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SUMO3P55854 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SUMO3P55854 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SUMO3P55854 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SUMO3P55854 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SUMO3P55854 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SUMO3P55854 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SUMO3P55854 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SUMO3P55854 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SUMO3P55854 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms